觀賞魚產業

開發長程包裝運輸技術，建立15種海葵魚、2種刺尾鯛魚及11種雀鯛魚量產技術。於屏東農業科技園區設置水族營運中心，形成以外銷出口為導向的產業聚落，已核准16家業者進駐，於102年3月完工啟用並試營運。舉辦觀賞魚博覽會拓銷國內外市場，98至101年累計參觀人次達53萬人次。101年觀賞魚產業含周邊產值達42.1億元，較98年倍增。

植物種苗：

歐盟植物品種保護局（CPVO）於99年11月8日通知，歐盟已就臺灣檢定通過之蝴蝶蘭至歐盟申請品種權之檢定流程草案完成審核，檢定費用由1,200歐元降為750歐元。99年11月舉辦「2010亞太種子年會」，計有亞太地區44國約1千人參與，透過品種示範圃展示與業者參訪，增加我國優質種苗知名度，估計為種苗業創造約15億元商機。

「海峽兩岸智慧財產權保護合作協議」已於99年6月29日簽署，並於99年9月12日生效。兩岸自99年11月22日開始受理對方植物品種權申請優先權主張，加強保護我國育種者權利及研發成果。101年產值達82.4億元。

種畜禽產業：

輔導優良畜牧場成為亞太種畜禽中心之核心畜牧場，推動人工授精配種技術，其中種豬、種乳牛與種雞之配種採人工授精之比率為100％。優良種豬專案輸銷越南，開啟我國優良種豬立足東南亞的契機。發展自動化控管之精準種畜禽場，提供健康、具動物保護概念及友善環境的畜牧生產。101年產值約為16億元。